Vakuuttuneena siitä, että kyberterroristi nimeltään Naurava Mies on palannut takaisin, Osasto 9 jouduttaa tutkimuksiaan. Majuri Kusanagi menee Nauravalle Miehelle omistettuun virtuaaliseen chat-huoneeseen ja kokee epätavallisen kohtaamisen. Mutta ovatko ihmiset ja heidän mielipiteensä siellä pelkkää fantasiaa vai onko totuus sittenkin olemassa? Myös muun maailman ongelmat astuvat mukaan kuvaan. Sarjamurhaaja nylkee uhrinsa elävältä kuin näillä olisi päällä T-paita.
Osasto 9:n on selvitettävä tämän murhaajan henkilöllisyys, ennen kuin hän saa seuraavan uhrinsa. Tällä välin Togusa vierailee laitoksessa, joka hoitaa suljettujen kyberaivojen oireyhtymästä kärsiviä potilaita, mutta hän löytää enemmän kuin osasi odottaa, mm. johtolangan Nauravan Miehen tapaukseen. Ja sitten yksi Tachikoma päättää lähteä huviajelulle ja tutustuu pikkutyttöön, joka etsii kadonnutta koiraansa.