Tulevaisuuden Tokio, vuosi 2049

Salaperäinen onnettomuus on halvaannuttanut kaupungin. Kolme prototyyppiasteen biologista sotakonetta – pelottomia ihmisten kaltaisia koneita – lähetetään tutkimaan katastrofin aiheuttajaksi epäillyn asevalmistajan pääkonttoria.

Kolmen koneen on käytettävä taistelutaitojaan ja valitsemiaan aseita taistelussaan läpi rakennuksen sokkelomaisten käytävien ja luolastojen. Koneiden on päästävä onnettomuuden alkulähteille ja korjattava sen vaikutukset, ennen kuin on liian myöhäistä….